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A medida que aumentaban las condenas por el síndrome del bebé sacudido, también aumentaban las dudas sobre la fiabilidad de dicho diagnóstico. En 2001, una investigación fundamental sobre accidentes en parques infantiles, realizada por un patólogo forense y médico forense de Minnesota, demostró que una caída, incluso desde una altura baja, o la caída de un objeto sobre un niño, podía provocar inflamación y hemorragia cerebral. El patólogo, John Plunkett, comenzó a testificar ante el tribunal en nombre de los acusados de síndrome del bebé sacudido. Como lo expresó un periodista de sucesos de The Washington Post : «Plunkett se convertía en una amenaza para los casos de síndrome del bebé sacudido en todo el país».
Los radiólogos pediátricos también estaban dando la voz de alarma. La Dra. Julie Mack ejercía a principios de la década de 2000 en Lancaster, Pensilvania, y había diagnosticado muchos casos de bebés conmocionados tras revisar tomografías computarizadas. «En la facultad de medicina, a todos nos enseñaban» que si no se podía explicar fácilmente la causa de la inflamación y el sangrado cerebral, «los padres debían estar ocultando algo», me dijo.
Para disipar sus crecientes dudas sobre este dogma, exploró la literatura anatómica y logró un gran avance. Descubrió que la duramadre, la membrana que separa el cráneo del cerebro, puede sangrar sin traumatismo, lo que resulta en un hematoma subdural, uno de los supuestos marcadores clave del síndrome de intestino irritable (SIC). Mack coescribió un artículo ampliamente citado con el Dr. Waney Squier , neuropatólogo británico especializado en cerebros infantiles.